身份参加讨论。在讨论中，出现了两派观点：一方以董讷为代表继续攻击靳辅及其副手陈潢；另一方以佛伦为代表，虽然在为自己开脱的同时，还是支持靳辅。讨论过程中，靳辅与于成龙之间的矛盾尤为突出，康熙帝发现于成龙在河务方面确实缺乏足够的知识。最终，康熙帝决定革除靳辅的河道总督职务，并任命福建总督王新命接替他的位置，陈潢也被解除了佥事道的职务。

靳辅被革职后不久，就有臣下向康熙帝报告了两件事情：一是漕运出现阻滞的情况，有人建议派遣靳辅去解决；另一件是中河已经开通，这是对靳辅工作的肯定。这两件事情让康熙帝感到为难，他意识到靳辅在治河方面的贡献，并担心新任河道总督王新命可能会推翻靳辅的所有工作，导致前功尽弃。为此，康熙帝派大臣进行调查，并指示他们保留靳辅所制定的规章制度，不要轻易更改。

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康熙二十八年（1689年）正月，靳辅被召扈从康熙帝南巡，沿途视察河务。在查看中河时，康熙帝询问靳辅当初是如何规划开浚中河的。靳辅解释说，这是根据康熙帝之前的巡视指示而提出的方案，开浚后不仅可以解决水淹民田的问题，还可以保障漕船的安全通行。康熙帝听后，指示王新命继续完成中河的善后事宜，并强调要加强遥堤和减水坝的建设。

三月，康熙帝基于南巡期间江淮百姓和船夫对靳辅的高度赞扬，以及亲眼见到靳辅治理的河道和加固的上河堤坝所取得的实际成效，认为之前对靳辅的革职处分过重。于是，他下令恢复靳辅先前的衔级，这是对靳辅名誉的一种恢复，但并不是恢复他的官职。

八、晚年

康熙二十七年（1688年）十一月，虽然靳辅已经被革职，但他仍旧承担起了临时性的任务。他与工部尚书苏赫一同前往通州运河进行检查，提出了在沙河建造水闸以蓄水，并在通州下游筑堤以约束水流的建议，这些措施都被采纳并实施。

次年，即康熙二十八年（1689年），靳辅再次被召随康熙帝南巡，沿路视察河务。这次南巡不仅是对靳辅专业能力的认可，也是对他之前工作的肯定。康熙帝在南巡期间亲身体验到了靳辅治河的成效，并在沿途听取了百姓和船夫对靳辅的高度评价，这使得康熙帝对靳辅的态度有了显着的转变。

康熙三十年（1691年）九月，靳辅又被委以重任，与户部侍郎博际、兵部侍郎李光地一同视察黄河险工。出发前，康熙帝特别提到靳辅“于河务最为谙练”，显示出他对靳辅的信任。靳辅在视察后提交了一份详尽的报告，报告中提到了黄河南北两岸无冲损的减水坝以及需要加固的地方，并绘制了相应的图纸供参考。这份报告被提交给九卿会议审议，并得到了一致同意，按照靳辅的建议执行。

康熙二十九年（1690年）三月，当漕运总督董讷提议将南旺河水引入北运河时，康熙帝再次召见靳辅咨询意见。靳辅建议通过在北运河两侧筑埽来约束水流，无需引南旺河水北流。这表明即使是在非正式的职位上，靳辅仍然以其专业知识发挥着重要作用。

到了康熙三十一年（1692年）二月，河道总督王新命因为贪污问题被揭发，康熙帝开始寻找合适的继任者。考虑到河务的重要性，他最终决定重新启用经验丰富的靳辅担任河道总督。尽管靳辅因年老体弱而试图推辞，但康熙帝坚持要求他出任此职，并安排顺天府丞徐廷玺协助他工作。

再次上任后的靳辅，尽管身体状况不佳，仍然全身心投入到了治河工作中。这一年，陕西西安、凤翔地区遭遇灾害，康熙帝下令截留漕粮用于救济。靳辅接受了运输漕粮的任务，并亲自监督运输过程，确保漕粮安全到达灾区。由于表现突出，他受到了康熙帝的赞赏。

然而